MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermincola potens JR chromosome

Total Repeats: 51739

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014152	A	6	6	129	134	100 %	0 %	0 %	0 %	296131551
2	NC_014152	AAGT	2	8	156	163	50 %	25 %	25 %	0 %	296131551
3	NC_014152	AT	3	6	190	195	50 %	50 %	0 %	0 %	296131551
4	NC_014152	GAT	2	6	223	228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131551
5	NC_014152	CTGAT	2	10	279	288	20 %	40 %	20 %	20 %	296131551
6	NC_014152	TC	3	6	298	303	0 %	50 %	0 %	50 %	296131551
7	NC_014152	AAT	2	6	352	357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296131551
8	NC_014152	ATT	2	6	369	374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131551
9	NC_014152	ACA	2	6	384	389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296131551
10	NC_014152	A	6	6	397	402	100 %	0 %	0 %	0 %	296131551
11	NC_014152	TA	3	6	605	610	50 %	50 %	0 %	0 %	296131551
12	NC_014152	AGT	2	6	634	639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131551
13	NC_014152	TTC	2	6	646	651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296131551
14	NC_014152	GAC	2	6	689	694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131551
15	NC_014152	AATA	2	8	713	720	75 %	25 %	0 %	0 %	296131551
16	NC_014152	CTT	2	6	737	742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296131551
17	NC_014152	GAA	2	6	785	790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131551
18	NC_014152	CAAA	2	8	822	829	75 %	0 %	0 %	25 %	296131551
19	NC_014152	ATT	2	6	833	838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131551
20	NC_014152	GCC	2	6	928	933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296131551
21	NC_014152	A	6	6	964	969	100 %	0 %	0 %	0 %	296131551
22	NC_014152	ATG	2	6	999	1004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131551
23	NC_014152	A	6	6	1185	1190	100 %	0 %	0 %	0 %	296131551
24	NC_014152	ACT	2	6	1200	1205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296131551
25	NC_014152	A	6	6	1234	1239	100 %	0 %	0 %	0 %	296131551
26	NC_014152	CT	3	6	1306	1311	0 %	50 %	0 %	50 %	296131551
27	NC_014152	GAA	2	6	1325	1330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131551
28	NC_014152	GGA	2	6	1334	1339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296131551
29	NC_014152	A	6	6	1371	1376	100 %	0 %	0 %	0 %	296131551
30	NC_014152	AAT	2	6	1391	1396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296131551
31	NC_014152	TAT	2	6	1414	1419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131551
32	NC_014152	GAA	2	6	1713	1718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131552
33	NC_014152	TATCT	2	10	1728	1737	20 %	60 %	0 %	20 %	296131552
34	NC_014152	TGA	2	6	1745	1750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131552
35	NC_014152	TGT	2	6	1842	1847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296131552
36	NC_014152	TTGA	2	8	1897	1904	25 %	50 %	25 %	0 %	296131552
37	NC_014152	ACA	2	6	1960	1965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296131552
38	NC_014152	TGGA	2	8	2009	2016	25 %	25 %	50 %	0 %	296131552
39	NC_014152	GCT	2	6	2083	2088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131552
40	NC_014152	TGG	2	6	2150	2155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296131552
41	NC_014152	AC	4	8	2162	2169	50 %	0 %	0 %	50 %	296131552
42	NC_014152	A	6	6	2219	2224	100 %	0 %	0 %	0 %	296131552
43	NC_014152	GAA	2	6	2287	2292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131552
44	NC_014152	AAC	2	6	2311	2316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296131552
45	NC_014152	GTT	2	6	2320	2325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296131552
46	NC_014152	CTT	2	6	2462	2467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296131552
47	NC_014152	TAA	2	6	2522	2527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296131552
48	NC_014152	GAA	2	6	2563	2568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131552
49	NC_014152	GAA	2	6	2653	2658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131552
50	NC_014152	ATT	2	6	2720	2725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131552
51	NC_014152	A	6	6	2867	2872	100 %	0 %	0 %	0 %	296131553
52	NC_014152	TCAA	2	8	2889	2896	50 %	25 %	0 %	25 %	296131553
53	NC_014152	AATTG	2	10	2909	2918	40 %	40 %	20 %	0 %	296131553
54	NC_014152	TTG	2	6	2950	2955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296131553
55	NC_014152	GGT	2	6	2981	2986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296131553
56	NC_014152	CTG	2	6	3039	3044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131554
57	NC_014152	TAT	2	6	3147	3152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131554
58	NC_014152	CA	3	6	3169	3174	50 %	0 %	0 %	50 %	296131554
59	NC_014152	ACT	2	6	3214	3219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296131554
60	NC_014152	GCG	2	6	3235	3240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296131554
61	NC_014152	GTTT	2	8	3257	3264	0 %	75 %	25 %	0 %	296131554
62	NC_014152	ATTAA	2	10	3300	3309	60 %	40 %	0 %	0 %	296131554
63	NC_014152	A	9	9	3319	3327	100 %	0 %	0 %	0 %	296131554
64	NC_014152	AT	3	6	3337	3342	50 %	50 %	0 %	0 %	296131554
65	NC_014152	TTA	3	9	3455	3463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131554
66	NC_014152	TTA	2	6	3468	3473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131554
67	NC_014152	A	6	6	3600	3605	100 %	0 %	0 %	0 %	296131554
68	NC_014152	A	7	7	3617	3623	100 %	0 %	0 %	0 %	296131554
69	NC_014152	AGA	2	6	3671	3676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131554
70	NC_014152	ATT	2	6	3743	3748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131554
71	NC_014152	A	6	6	3754	3759	100 %	0 %	0 %	0 %	296131554
72	NC_014152	AGC	2	6	3761	3766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131554
73	NC_014152	GAA	2	6	3777	3782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131554
74	NC_014152	ATT	2	6	3801	3806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131554
75	NC_014152	TCT	2	6	3829	3834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296131554
76	NC_014152	CAA	2	6	3876	3881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296131554
77	NC_014152	TC	3	6	3891	3896	0 %	50 %	0 %	50 %	296131554
78	NC_014152	GGAACT	2	12	3911	3922	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	296131554
79	NC_014152	TTG	2	6	3954	3959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296131554
80	NC_014152	GAT	2	6	3963	3968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131554
81	NC_014152	AGA	2	6	3993	3998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131554
82	NC_014152	TATT	2	8	4002	4009	25 %	75 %	0 %	0 %	296131554
83	NC_014152	ACA	2	6	4044	4049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296131554
84	NC_014152	TTG	2	6	4062	4067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296131554
85	NC_014152	A	8	8	4080	4087	100 %	0 %	0 %	0 %	296131554
86	NC_014152	ATA	2	6	4116	4121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296131554
87	NC_014152	TTC	2	6	4145	4150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296131555
88	NC_014152	GAG	2	6	4157	4162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296131555
89	NC_014152	TAA	2	6	4166	4171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296131555
90	NC_014152	ATT	2	6	4195	4200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131555
91	NC_014152	A	7	7	4215	4221	100 %	0 %	0 %	0 %	296131555
92	NC_014152	AAT	2	6	4228	4233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296131555
93	NC_014152	GAA	2	6	4261	4266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131555
94	NC_014152	A	6	6	4285	4290	100 %	0 %	0 %	0 %	296131555
95	NC_014152	TTTTC	2	10	4328	4337	0 %	80 %	0 %	20 %	296131555
96	NC_014152	TTC	2	6	4344	4349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296131555
97	NC_014152	A	6	6	4359	4364	100 %	0 %	0 %	0 %	296131555
98	NC_014152	GAA	2	6	4372	4377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131555
99	NC_014152	AAT	2	6	4391	4396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296131555
100	NC_014152	TATC	2	8	4519	4526	25 %	50 %	0 %	25 %	296131556
101	NC_014152	AAG	2	6	4559	4564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131556
102	NC_014152	AG	3	6	4568	4573	50 %	0 %	50 %	0 %	296131556
103	NC_014152	AAAT	2	8	4596	4603	75 %	25 %	0 %	0 %	296131556
104	NC_014152	A	6	6	4612	4617	100 %	0 %	0 %	0 %	296131556
105	NC_014152	GTT	2	6	4633	4638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296131556
106	NC_014152	TAT	2	6	4758	4763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131557
107	NC_014152	GAAA	2	8	4788	4795	75 %	0 %	25 %	0 %	296131557
108	NC_014152	GAA	2	6	4798	4803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131557
109	NC_014152	GAA	2	6	4852	4857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131557
110	NC_014152	CGG	2	6	4975	4980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296131557
111	NC_014152	AGGCA	2	10	5025	5034	40 %	0 %	40 %	20 %	296131557
112	NC_014152	T	6	6	5061	5066	0 %	100 %	0 %	0 %	296131557
113	NC_014152	GAA	2	6	5089	5094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131557
114	NC_014152	GAG	2	6	5122	5127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296131557
115	NC_014152	A	6	6	5257	5262	100 %	0 %	0 %	0 %	296131557
116	NC_014152	A	6	6	5511	5516	100 %	0 %	0 %	0 %	296131557
117	NC_014152	GA	3	6	5568	5573	50 %	0 %	50 %	0 %	296131557
118	NC_014152	GAA	2	6	5578	5583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131557
119	NC_014152	GAAAA	2	10	5600	5609	80 %	0 %	20 %	0 %	296131557
120	NC_014152	GA	3	6	5669	5674	50 %	0 %	50 %	0 %	296131557
121	NC_014152	A	6	6	5712	5717	100 %	0 %	0 %	0 %	296131557
122	NC_014152	AGA	2	6	5802	5807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131557
123	NC_014152	CGAG	2	8	5833	5840	25 %	0 %	50 %	25 %	296131557
124	NC_014152	ACA	2	6	5861	5866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296131557
125	NC_014152	TCGAC	2	10	5895	5904	20 %	20 %	20 %	40 %	296131557
126	NC_014152	CAT	2	6	5979	5984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296131557
127	NC_014152	GAA	2	6	6002	6007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131557
128	NC_014152	TGG	2	6	6041	6046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296131557
129	NC_014152	GCCA	2	8	6381	6388	25 %	0 %	25 %	50 %	296131558
130	NC_014152	TA	3	6	6438	6443	50 %	50 %	0 %	0 %	296131558
131	NC_014152	AGT	2	6	6485	6490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131558
132	NC_014152	TGA	2	6	6503	6508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131558
133	NC_014152	TCA	2	6	6548	6553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296131558
134	NC_014152	GGA	2	6	6660	6665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296131558
135	NC_014152	CGG	2	6	6695	6700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296131558
136	NC_014152	GTT	2	6	6723	6728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296131558
137	NC_014152	AT	4	8	6775	6782	50 %	50 %	0 %	0 %	296131558
138	NC_014152	ATA	2	6	6825	6830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296131558
139	NC_014152	T	6	6	6941	6946	0 %	100 %	0 %	0 %	296131558
140	NC_014152	A	6	6	6994	6999	100 %	0 %	0 %	0 %	296131558
141	NC_014152	GAGG	2	8	7011	7018	25 %	0 %	75 %	0 %	296131558
142	NC_014152	ATC	2	6	7020	7025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296131558
143	NC_014152	TAAA	2	8	7042	7049	75 %	25 %	0 %	0 %	296131558
144	NC_014152	TGC	2	6	7060	7065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131558
145	NC_014152	GAC	2	6	7098	7103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131558
146	NC_014152	TGG	2	6	7108	7113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296131558
147	NC_014152	ATG	2	6	7132	7137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131558
148	NC_014152	TCTTT	2	10	7153	7162	0 %	80 %	0 %	20 %	296131558
149	NC_014152	AAT	2	6	7278	7283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296131558
150	NC_014152	TAA	2	6	7321	7326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296131558
151	NC_014152	T	6	6	7433	7438	0 %	100 %	0 %	0 %	296131558
152	NC_014152	GGA	2	6	7439	7444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296131558
153	NC_014152	CAT	2	6	7558	7563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296131558
154	NC_014152	CTG	2	6	7600	7605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131558
155	NC_014152	AGG	2	6	7640	7645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296131558
156	NC_014152	AGA	2	6	7668	7673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131558
157	NC_014152	GAG	2	6	7749	7754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296131558
158	NC_014152	GAT	2	6	7794	7799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131558
159	NC_014152	AT	3	6	7804	7809	50 %	50 %	0 %	0 %	296131558
160	NC_014152	TTA	2	6	7831	7836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131558
161	NC_014152	TGT	2	6	7879	7884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296131558
162	NC_014152	CTTT	2	8	7888	7895	0 %	75 %	0 %	25 %	296131558
163	NC_014152	AT	3	6	7901	7906	50 %	50 %	0 %	0 %	296131558
164	NC_014152	TA	3	6	7935	7940	50 %	50 %	0 %	0 %	296131558
165	NC_014152	GCC	2	6	7946	7951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296131558
166	NC_014152	TA	3	6	7954	7959	50 %	50 %	0 %	0 %	296131558
167	NC_014152	AAG	2	6	7965	7970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131558
168	NC_014152	GCT	2	6	8015	8020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131558
169	NC_014152	AT	3	6	8251	8256	50 %	50 %	0 %	0 %	296131558
170	NC_014152	GAA	2	6	8433	8438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131559
171	NC_014152	ATGAA	2	10	8486	8495	60 %	20 %	20 %	0 %	296131559
172	NC_014152	A	6	6	8632	8637	100 %	0 %	0 %	0 %	296131559
173	NC_014152	TGCC	2	8	8730	8737	0 %	25 %	25 %	50 %	296131559
174	NC_014152	GAC	2	6	8890	8895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131559
175	NC_014152	TGT	2	6	8910	8915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296131559
176	NC_014152	TCA	2	6	8942	8947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296131559
177	NC_014152	TTC	2	6	8952	8957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296131559
178	NC_014152	GATA	2	8	9033	9040	50 %	25 %	25 %	0 %	296131559
179	NC_014152	TGA	2	6	9065	9070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131559
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181	NC_014152	TAT	3	9	9105	9113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131559
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183	NC_014152	A	7	7	9289	9295	100 %	0 %	0 %	0 %	296131559
184	NC_014152	TGA	2	6	9318	9323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131559
185	NC_014152	GTT	2	6	9382	9387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296131559
186	NC_014152	GTT	2	6	9396	9401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296131559
187	NC_014152	TGG	2	6	9449	9454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296131559
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192	NC_014152	GAA	2	6	9760	9765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131559
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199	NC_014152	GAG	2	6	10031	10036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296131559
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205	NC_014152	ATA	2	6	10151	10156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296131559
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220	NC_014152	CCA	2	6	10775	10780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296131559
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231	NC_014152	CCTG	2	8	11604	11611	0 %	25 %	25 %	50 %	296131560
232	NC_014152	AAG	2	6	11612	11617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131560
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239	NC_014152	A	7	7	12065	12071	100 %	0 %	0 %	0 %	296131561
240	NC_014152	ATT	2	6	12102	12107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131561
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242	NC_014152	CTT	2	6	12138	12143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296131561
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248	NC_014152	TGG	2	6	12532	12537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296131561
249	NC_014152	A	6	6	13367	13372	100 %	0 %	0 %	0 %	296131562
250	NC_014152	TAT	2	6	13518	13523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296131562
251	NC_014152	TAG	2	6	13637	13642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131562
252	NC_014152	CAA	2	6	13683	13688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296131562
253	NC_014152	AGG	2	6	13697	13702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296131562
254	NC_014152	TGC	2	6	13728	13733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131562
255	NC_014152	CAA	2	6	13821	13826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296131562
256	NC_014152	GAC	2	6	14002	14007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131562
257	NC_014152	CTA	2	6	14036	14041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296131562
258	NC_014152	AAC	2	6	14068	14073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296131562
259	NC_014152	GGC	2	6	14146	14151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296131562
260	NC_014152	GCA	2	6	14249	14254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296131562
261	NC_014152	TGA	2	6	14261	14266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131562
262	NC_014152	ATGCC	2	10	14390	14399	20 %	20 %	20 %	40 %	296131562
263	NC_014152	TAA	2	6	14458	14463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296131562
264	NC_014152	GAA	2	6	14610	14615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131563
265	NC_014152	ATG	2	6	14641	14646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296131563
266	NC_014152	TGC	2	6	14690	14695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131563
267	NC_014152	GCC	2	6	14757	14762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296131563
268	NC_014152	TGCT	2	8	14839	14846	0 %	50 %	25 %	25 %	296131563
269	NC_014152	AAG	2	6	14884	14889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131563
270	NC_014152	CTG	2	6	14971	14976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296131563
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273	NC_014152	TAA	2	6	15149	15154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296131563
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276	NC_014152	AGA	2	6	15287	15292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296131563
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345	NC_014152	G	6	6	20349	20354	0 %	0 %	100 %	0 %	296131566
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